Похоже, что так задумано великими умами из МБС и справедливо как для 3 версии, так и для 2.5.
Попробуй купить ОС через закупку, оттуда же создай необходимые ОС. Можешь на закупку разнести накладные расходы. После обработки закупки, причем каждого этапа (заявка, отборочная накладная, накладная) покупная стоимость будет аккуратно переноситься в модели учета.
Вообще говоря, модуль ОС в аксапте очень похож на настоящий, только вот когда попытаешься с ним работать...