[sukhanchik]

скрипты нужны тогда - когда Вам нужно обновить Ваши данные. Для чистой АХ - эту роль выполняет штатный checkList.
Если у Вас модифицированная АХ (в том смысле - что есть потребность при обновлении версии проходить джобиком по вашим данным) то Вы можете поступить двояко:
1. Составить список джобиков, которые должны обновить данные и при обновлении их все выполнить. Плюс такого подхода - скорость разработки. Минус - скорость обновления - в плане того, что во время обновления надо будет помнить список джобиков, в каком порядке и как их запускать, а также сидеть и ждать когда отработает долгий джоб
2. Модифицировать (создать свой) класс-наследник ReleaseUpdateDB. В нем задать последовательность исполнения джобиков до синхронизации (initPreSyncJobs) и после синхронизации (initPostSyncJobs)