[Ivanhoe]

Речь не про задолженность и проводки.
Речь про связь клиента и заказа (накладной), цены продаж и скидки, отчеты по продажам, расчет статистики (Запросы / История / Управленческая статистика), стандартные ОЛАП кубы и т.п. Посмотрите, какие заказы открываются из формы Клиентов - именно по полю "Счет" идет фильтр.
Т.е. если в поле "Счет" у вас "левый" клиент - то это плохо.

"Счет" и "Счет на" удобно когда есть связь между дочерней компанией и головной, которая платит за дочернюю. А когда реально и сам заказ (и весь документооборот по нему), и платежи будут по одному клиенту, но грузополучатель в печатных документах другой - такой способ не подойдет.