теоретически можно, если все стандартно то ни на что повлиять вроде не должно.
Единственный нюанс, который приходит в голову, это могут возникнуть разночтения с физическими остатками. Т.е. реально товара уже нет, а по системе ещё есть
(пример товар отгрузили 1-ого, накладную разнесли 4-м числом. в период с 1-ого по 3-е по системе будет показываться наличие товара, которого нет.)