Идея с Шаблонами отгрузок (они так по русски называются?) неплохая, но, imho, не доведена до конца. Было бы не плохо иметь больше вариативности в их настройке, и чтобы они применялись при любом автоматическом резервировании, а не только по использовании Shipment.
А так, по теме, мне тоже нравится Профиль учета, но раз не используете.. Напильник в руки

P.S. ну или вариант резервирования брака, например, под перенос или под журнал складской, чтобы никто другой в принципе не мог этот товар зарезервировать.