1) Не понятно
проводка Д10.99 КZ001 вас устроит? при условии что ТМЦ "хранятся" на 10.01 счете? Или все-таки нужно "перенести" ТМЦ Д10.99 К10.01?
Какой экономический смысл этой операции? С какого счета в дальнейшем должны списываться ТМЦ при отгрузках с этого склада?
2) См. описание RU-3, стр. 18. Аналогичная галка была в разноске накладных по заказам как минимум с Axapta 3.0.
3) При этом достаточно много сделано в стандарте для заполнения этого поля по умолчанию. Возможно, не так все страшно.
4) Значит речь про форму. В указанной форме настраиваются счета для учета операций. В том числе можно сделать настройку в разрезе профилей учета. В том числе настроить разные счета для приемки ТМЦ на складе для разных профилей.
5) На вскидку:
Опыт настройки проводки 10 -> 20 с помощью профилей в AX2009
Заказы на перемещения и проводки в ГК в DAX2009
И даже по истории вопроса
Формирование проводок по внутреннему перемещению