В топку Installation Guide по 4.0 и 2009 там как-то криво было описана установка с порталом, помогал метод проб и ошибок.
Очень вменяемая инструкция была на mazzy.ru, по ней когда-то давно без проблем установил портал:
Установка AX 2009 на одном компьютере на MS Windows Server 2008