Стандартная операция:
Расчеты с клиентами/Периодические операции/Сопоставление/Периодическое сопоставление...
указываем код клиента, проч.параметры... нажимаем ОК и сопоставляется...
правда, это лучше использовать когда всё равно что с чем будет сопоставлено ....
если не подходит, то значит я не понял вопроса...

только вот почему именно "Программное сопоставление..."