Онлайновых как грязи.
Здесь
SQL Formatter Web Service есть пример, как можно задействовать один из них в ASP.net приложении
Оттуда же есть ссылка сюда
SQL Parser engine used by SQL formatter, где можно скачать оффлайновый форматтер (требует регистрации, без нее запускается 30 раз)