По моему мнению, Финансы и Бухучет в Navision лучше будут. У нас бухгалтера поплакались и привыкли причем достаточно быстро. Главная книга, навиженовская корреспонденция и др. для них вполне подошли. Пришлось правда доработать кое-какие отчеты (например, оборотку по аналитике), но это мелочи. Кое-что дописали в банк/касса... Бюджетирование пока не внедряли, но в Navisionе больше приклада к нашим условиям. З/п настроили в том числе и по раздельному учету (ЕНВД и стандартная система налогообложения)... вот так.
P.S. Правда мнение мое не очень объективно. Так получилось, что сертифицировался по Аксапта, а внедряю Навижн