Запуск вебсервиса на стороне сервера

[Logger]

вы же как-то обрабатываете там исключения ?
попробуйте добавить чт-то типа такого

    catch(Exception::CLRError)
    {
        throw error(AifUtil::getClrErrorMessage());
    }

это позволит получить более детальное сообщение об ошибке и подскажет что не так.
Скорее всего у вас на сервере что-то не зарегистрировано как на клиенте или не та версия сборки (net2.0 или net3.5) - обратите также внимание на версию.

[Товарищ ♂uatr]

Добрый вечер.
Bin и GAC взаимоисключают друг друга. Скорее всего забыли связанные библиотеки сложить по соседству - перепроверьте зависимости.
Возможно эта тема поможет решить проблему: При компиляции не видит подключённых dll через references
Вы в сторону ссылок на сервис автогенерируемых Аксаптой не смотрели? Оно, вроде, априори на сервере развёртывается.